Titre original :

Mise en place du diagnostic de mucormycoses par PCR en temps réel au CHU de Lille. Extraction automatisée d’ADN circulant sur Microlab STARlet t Hamilton®

Mots-clés en français :
  • Mucormycose
  • mucorales
  • infections fongiques invasives
  • PCR en temps réel
  • ADN circulant
  • extraction d’ADN
  • norme NF EN ISO 15189

  • Mucormycose
  • Mucormycose
  • Langue : Français
  • Discipline : Pharmacie. Biologie médicale
  • Identifiant : 2017LIL2E034
  • Type de thèse : Doctorat de pharmacie
  • Date de soutenance : 07/04/2017

Résumé en langue originale

Les mucormycoses (MM) sont des infections fongiques dues à des moisissures de l’environnement appartenant à l’ordre des Mucorales. Ces infections majoritairement opportunistes sont rares mais de sombre pronostic. Actuellement le diagnostic repose sur la culture, méthode de référence, de faible rendement et de réponse tardive. L’objectif de ce travail était la mise en place et l’évaluation d’une méthode de PCR en temps réel et l’automatisation de l’extraction d’ADN fongique circulant pour l’amélioration du diagnostic des MM. Le MICROLAB STARlet (Hamilton®), l’AutoMag (Ademtech) et le MagNA Pure Compact (Roche), respectivement associés aux kits NucleoSpin® 96 DNA plasma (Macherey Nagel), MycoGENIE® Af DNA (Ademtech) et Large Volume MagNA Pure Nucleic Acid Isolation (Roche), ont été comparés pour l’extraction d’ADN circulant. Des échantillons artificiellement contaminés et cliniques ont été analysés. La méthode de PCR a été mise en place et validée selon les exigences de la norme NF EN ISO 15189. La comparaison des méthodes d’extraction a permis d’identifier l’automate MICROLAB STARlet (Hamilton®) associé à un kit Macherey Nagel comme étant la méthode permettant de concilier les impératifs techniques, économiques et cliniques du laboratoire. La PCR Mucorales en temps réel apparait comme une méthode sensible et spécifique permettant un diagnostic plus précoce que les méthodes conventionnelles.

Résumé traduit

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  • Directeur(s) de thèse : Cornu, Marjorie

AUTEUR

  • Guérin, Meggie
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