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<dc:title xml:lang="fr">Mise en place du diagnostic de mucormycoses par PCR en temps réel au CHU de Lille. Extraction automatisée d’ADN circulant sur Microlab STARlet t Hamilton®</dc:title>
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<dcterms:abstract xml:lang="fr">Les mucormycoses (MM) sont des infections fongiques dues à des moisissures de l’environnement appartenant à l’ordre des Mucorales. Ces infections majoritairement opportunistes sont rares mais de sombre pronostic.
Actuellement le diagnostic repose sur la culture, méthode de référence, de faible
rendement et de réponse tardive. L’objectif de ce travail était la mise en place et
l’évaluation d’une méthode de PCR en temps réel et l’automatisation de
l’extraction d’ADN fongique circulant pour l’amélioration du diagnostic des MM.
Le MICROLAB STARlet (Hamilton®), l’AutoMag (Ademtech) et le MagNA
Pure Compact (Roche), respectivement associés aux kits NucleoSpin® 96 DNA
plasma (Macherey Nagel), MycoGENIE® Af DNA (Ademtech) et Large Volume
MagNA Pure Nucleic Acid Isolation (Roche), ont été comparés pour l’extraction
d’ADN circulant. Des échantillons artificiellement contaminés et cliniques ont été
analysés.
La méthode de PCR a été mise en place et validée selon les exigences de
la norme NF EN ISO 15189. La comparaison des méthodes d’extraction a permis
d’identifier l’automate MICROLAB STARlet (Hamilton®) associé à un kit Macherey
Nagel comme étant la méthode permettant de concilier les impératifs techniques,
économiques et cliniques du laboratoire.
La PCR Mucorales en temps réel apparait comme une méthode sensible et
spécifique permettant un diagnostic plus précoce que les méthodes
conventionnelles.</dcterms:abstract>
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