• Langue : Français
• Discipline : Pharmacie
• Identifiant : 2021LILUE149
• Type de thèse : Doctorat de pharmacie
• Date de soutenance : 02/09/2021

Résumé en langue originale

La diffusion de A. baumannii dans les hôpitaux et notamment dans les unités de soins intensifs comme ceux de réanimation des brûlés apparait comme une menace au vu de la proportion importante des souches multirésistantes. Le typage épidémiologique bactérien est un outil efficace pour juguler la dissémination de ces clones. L’étude d’une épidémie survenue dans le service de réanimation des brûlés du CHRU de Lille entre 2017 et 2019 nous a permis d’évaluer les nouvelles méthodes de typage et d’appréhender l’impact associé aux colonisations et infections à A. baumannii en termes de mortalité. Matériel et méthodes : Au cours de l’épidémie, 16 patients ont été colonisés et/ou infectés avec des souches de A. baumannii porteur d’une carbapénémase de type Oxa-23 dont le phénotype de résistance aux aminosides fluctuait au cours du temps. Nous avons évalué différentes méthodes de typage : l’antibiotype, la MLST, la spectrométrie de masse MALDI-ToF, la spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier (IR-TF) et la cgMLST. Les gènes de résistance aux aminosides ont été recherchés et le recueil des données cliniques a également été réalisé. Résultats : au total, l’antibiotype a mis en évidence 4 profils de résistance différents dont 2 ont diffusé au cours du temps. Ces clones sont regroupés au sein du ST 2 selon la technique MLST. Cependant, le typage par spectroscopie infrarouge et le cgMLST mettent en évidence que ces clones sont indépendants et que l’épidémie est reliée à deux clones distincts. Les données cliniques mettent en évidence que les infections dont les bactériémies ne sont pas reliées à une surmortalité bien que la plupart n’ont pas été traitées de manière adaptée. Conclusion : La IR-TF montre d’excellents résultats pour le typage bactérien de façon comparable à l’étude du core genome. Ces techniques apparaissent comme des méthodes d’avenir au détriment du typage par MLST et par spectrométrie de masse MALDI-ToF qui sont moins performants. Chez le patient brûlé, les infections dont les bactériémies à A. baumannii ne semblent pas induire une surmortalité même en cas de traitement non ciblé