• Langue : Français
• Discipline : Médecine. Biologie Médicale
• Identifiant : 2013LIL2M336
• Type de thèse : Doctorat de médecine
• Date de soutenance : 28/10/2013

Résumé en langue originale

Le genre Neisseria comprend deux espèces pathogènes strictes de l’Homme, Neisseria gonorrhoeae et Neisseria meningitidis, mais aussi d’autres espèces commensales humaines et animales, possible pathogènes opportunistes ou d’inoculation. L’évolution de la taxonomie de ce groupe bactérien et les nouvelles techniques d’identification bactérienne mettent en question les méthodes d’identification traditionnelles des Neisseriae. Une collection des 50 souches a été identifiée par la spectrométrie de masse MALDI-ToF (MS-MT), selon le protocole utilisé en routine et parallèle par séquençage génétique du gène recA ou à défaut du gène de l’ARN ribosomal 16S à l’aide d’arbres phylogénétiques. La technique MS-MT a identifié 46 des 50 souches, mais de façon erronées pour les 3 souches de N. polysaccharea, confondues avec le méningocoque. La distinction des souches commensales entre les deux groupes N. mucosa et N. subflava est satisfaisante, confirmée par la phylogénie recA. Pour les espèces animales, en cas de défaut de la MS-MT (absence de spectre de référence), le séquençage génétique de l’ARNr 16S a permis d’identifier N. canis et N. animaloris, pathogènes par morsures animales. Les espèces de morphologie bacillaire N. bacilliformis et N. weaveri ont été correctement identifiés par MS-MT. Ces résultats soulignent l’apport de la MS-MT pour l’identification bactérienne en routine et valide le gène recA comme recours pour le séquençage en première ligne.

Résumé traduit

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