Université Lille 2 Droit et Santé Identification des Neisseria en médecine humaine : évaluation de la spectrométrie de masse MALDI-ToF et du séquençage génétique conventionnel Neisseria, MALDI-ToF, identification bactérienne, ARNr 16S, recA, Spectroscopie de masse, Séquençage des acides nucléiques, Spectrométrie de masse, Analyse de séquence d'ARN 610 Le genre Neisseria comprend deux espèces pathogènes strictes de l’Homme, Neisseria gonorrhoeae et Neisseria meningitidis, mais aussi d’autres espèces commensales humaines et animales, possible pathogènes opportunistes ou d’inoculation. L’évolution de la taxonomie de ce groupe bactérien et les nouvelles techniques d’identification bactérienne mettent en question les méthodes d’identification traditionnelles des Neisseriae. Une collection des 50 souches a été identifiée par la spectrométrie de masse MALDI-ToF (MS-MT), selon le protocole utilisé en routine et parallèle par séquençage génétique du gène recA ou à défaut du gène de l’ARN ribosomal 16S à l’aide d’arbres phylogénétiques. La technique MS-MT a identifié 46 des 50 souches, mais de façon erronées pour les 3 souches de N. polysaccharea, confondues avec le méningocoque. La distinction des souches commensales entre les deux groupes N. mucosa et N. subflava est satisfaisante, confirmée par la phylogénie recA. Pour les espèces animales, en cas de défaut de la MS-MT (absence de spectre de référence), le séquençage génétique de l’ARNr 16S a permis d’identifier N. canis et N. animaloris, pathogènes par morsures animales. Les espèces de morphologie bacillaire N. bacilliformis et N. weaveri ont été correctement identifiés par MS-MT. Ces résultats soulignent l’apport de la MS-MT pour l’identification bactérienne en routine et valide le gène recA comme recours pour le séquençage en première ligne. ... Electronic Thesis or Dissertation Text Image fr application/pdf 1 : 0 Ko https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2013/2013LIL2M336.pdf Guihéneuf Raphaël 1984-12-23 FR 174967187 1147 2013LIL2M336 2013-10-28 Médecine. Biologie Médicale Université Lille 2 Droit et Santé thesis.degree.grantor_1 026404389 Doctorat de médecine non oui Gaillot Olivier intervenant_1 035581964 ddc:610 Gaillot Olivier Université Lille 2 Droit et Santé Université Lille 2 Droit et Santé ASCII PDF 1