• Langue : Français, Anglais
• Discipline : Recherche clinique, innovation technologique, santé publique
• Identifiant : 2025ULILS030
• Type de thèse : Doctorat
• Date de soutenance : 28/11/2025

Résumé en langue originale

Ce travail de thèse s’inscrit dans le champ des maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI) réfractaires. Elle combine des apports originaux sur l’immunité innée dans les MICI et des données issues de la recherche clinique. La première partie de ce travail a eu pour objectif d’apporter des connaissances nouvelles sur l’immunité innée dans les MICI réfractaires et concerne une étude expérimentale réalisée dans les ganglions lymphatiques mésentériques. Cette étude, conduite sous la co-direction du Dr Chapuy (Montréal) a utilisé la technologie CITE-seq (Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing). Elle a permis de caractériser les populations de cellules immunitaires innées dans les ganglions mésentériques de patients atteints de MICI : phagocytes mononuclées (MNP), cellules NK et cellules lymphoïdes innées (ILC). Les échantillons ont été fournis parle laboratoire du Dr Marika Sarfati du CR-CHUM (Montréal). Les analyses ont été réalisées avec l’appui de la plateforme de bio-informatique de l’Hôpital Sainte-Justine (Montréal). Les résultats finaux ont conduit à une publication dans Inflammatory Bowel Diseases. Cette étude met en évidence des spécificités transcriptionnelles des cellules innées dans les ganglions mésentériques des patients atteints de MICI réfractaires. Elle contribue à mieux comprendre leur rôle dans la physiopathologie intestinale. La seconde partie de ma thèse illustre les enjeux cliniques de ma recherche. Un premier article a étudié l’évolution en parallèle de la destruction intestinale par l’étude du score de Lémann, et du handicap fonctionnel par l’Inflammatory Bowel Disease-Disability Index (IBD-DI), chez des patients atteints de maladie de Crohn. Ce travail a été publié en 2025. Un second article a porté sur l’efficacité de l’intensification de la dose du vedolizumab sous-cutané chez des patients atteints de MICI présentant une non-réponse ou une perte de réponse à la dose standard. Il s’agit d’une étude multicentrique du GETAID (OPTI-VEDO), acceptée récemment dans Journal of Crohn’s and Colitis. Ce travail de thèse illustre l’importance d’une approche multiple pour appréhender la complexité des MICI grâce à la complémentarité du décryptage des mécanismes cellulaires immunitaires, une meilleure description de leur évolution clinique et une optimisation de leur prise en charge thérapeutique.

Résumé traduit

This work focuses on refractory inflammatory bowel diseases (IBD). This work combines original contributions on innate immunity in IBD with data derived from clinical research. The first part of this work aims to provide new insights into innate immunity in refractory IBD through an experimental study conducted in mesenteric lymph nodes. This study, carried out under the co-supervision of Dr. Chapuy (Montreal), used CITE-seq (Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing) technology to characterize innate immune cell populations in the mesenteric lymph nodes of IBD patients, including mononuclear phagocytes (MNP), NK cells, and innate lymphoid cells (ILC). The samples were provided by Dr. Marika Sarfati's laboratory at CR-CHUM (Montreal), and the analyses were supported by the bioinformatics platform at Sainte-Justine Hospital (Montreal). The final results led to a publication in Inflammatory Bowel Diseases. This study highlights transcriptional specificities of innate immune cells in mesenteric lymph nodes of patients with refractory IBD, contributing to a better understanding of their role in intestinal pathophysiology. The second part of the thesis illustrates the clinical dimension of this research. A first article investigated the parallel evolution of intestinal damage, assessed by the Lémann score, and functional disability, measured by the Inflammatory Bowel Disease-Disability Index (IBD-DI), in patients with Crohn's disease. This work was published in 2025. A second article evaluated the efficacy of subcutaneous vedolizumab dose intensification in IBD patients experiencing non-response or loss of response to the standard dose. This multicenter GETAID study (OPTI-VEDO) was recently accepted for publication in Journal of Crohn's and Colitis. Overall, this thesis underscores the importance of a multidimensional approach to address the complexity of IBD, combining the deciphering of immune cellular mechanisms, a better characterization of clinical disease progression, and the optimization of therapeutic management.