• Langue : Français, Anglais
• Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
• Identifiant : 2023ULILS111
• Type de thèse : Doctorat
• Date de soutenance : 11/12/2023

Résumé en langue originale

Le concept d'une Santé Globale a émergé depuis le début des années 2000 en partant du principe qu'il existe une interdépendance entre les actions anthropiques et l'émergence de maladies à potentiel pandémique. Cette approche intégrée repose sur une démarche holistique établissant un continuum entre les pratiques liées à l'élevage d'animaux de rente, leur écosystème et les humains en relation plus ou moins étroite avec ces mêmes animaux.Les travaux présentés s'appuient sur la mobilisation, le développement d'outils moléculaires et analytiques s'attachant à sécuriser, optimiser une phase précoce de notre système alimentaire : la sélection et la reproduction animale. La production de semence animale et plus particulièrement, celle de verrat, a pour particularité d'être couramment produite et distribuée en frais. De ce fait, celle-ci est le plus souvent stabilisée, après dilution, par l'emploi d'antibiotiques. Un grand empirisme préside à l'élaboration des formulations d'antibiotiques utilisées dans ce contexte. Ce support en fait un modèle original pour l'étude de l'émergence de bactéries résistantes aux antibiotiques.Prenant pour point de départ cette production à la base d'une filière agro-alimentaire, les travaux présentés auront pour objectif de démontrer comment les outils génomiques peuvent concourir à une meilleure appréhension de l'émergence de bactéries résistantes, et comment ils peuvent être invoqués pour apporter des solutions permettant d'amoindrir le risque de cette émergence. Une extension à d'autres contextes montrera dans quelle mesure ces approches permettraient une plus grande efficacité dans la prise en charge de cas d'infections humaines ou animales. Les travaux et le parcours proposés relatent, d'une part, des applications innovantes bâties sur les technologies génomiques en tentant d'établir, d'autre part, des passerelles et possibilités de transferts de méthodologies entre des applications liées à l'élevage et celles liées à la santé humaine.

Résumé traduit

The Global Health concept emerged in the early 2000s, on the premise that there is an interrelationship between human actions and the emergence of diseases with pandemic potential. This integrative approach is based on a holistic process linking livestock farming practices, their ecosystems and humans in close or less close contact with these animals.The work presented here relies on the mobilization and development of molecular and analytical tools aimed at securing and optimizing an early phase of our food system: animal selection and reproduction. The production of animal semen, particularly boar semen, is characterized by its widespread fresh production and distribution. As a result, it is usually conditioned, upon dilution, through the use of antibiotics. Antibiotic formulations used in this context are developed empirically. As a result, it provides an original model for studying the emergence of antibiotic-resistant bacteria.Based on this production, which underpins the agri-food industry, the work presented will aim to demonstrate how genomic tools can contribute to a better understanding of the emergence of resistant bacteria, and how they can be applied to provide solutions to reduce the risk of such an emergence. An extension to other contexts will reveal the potential of these approaches to improve the effectiveness of human and animal infection management. The proposed work and itinerary relate, on the one hand, innovative applications built on genomic technologies and, on the other hand, attempt to establish bridges and opportunities for transferring methodologies between livestock and human health applications.