• Langue : Français
• Discipline : Pharmacie. Biologie médicale
• Identifiant : 2018LILUE100
• Type de thèse : Doctorat de pharmacie
• Date de soutenance : 04/10/2018

Résumé en langue originale

Les gastro-entérites aiguës sont une cause majeure de consultation et d’hospitalisation chez les enfants. De nouvelles techniques moléculaires syndromiques ont vu le jour récemment, plus sensibles et surtout plus rapides que les méthodes diagnostiques conventionnelles. Cette étude est destinée à évaluer l’apport de l’introduction du panel gastro-intestinal FilmArray® (FA-GP) dans le diagnostic et la prise en charge des GEA en pédiatrie. Deux phases se sont succédées, la première destinée à comparer les performances du FA-GP à celles des techniques conventionnelles, puis une deuxième destinée à évaluer l’impact clinique de ces résultats via des questionnaires destinés aux pédiatres. Au total, nous avons analysé 182 échantillons de selles par technique moléculaire. Au cours de la première phase, 66,7% des échantillons étaient positifs par le FA-GP contre 24,7% par les techniques conventionnelles. Une association de plusieurs pathogènes a été mise en évidence dans 23,7% des échantillons par la FA-GP, aucune par les techniques conventionnelles. Durant la deuxième phase, le FA-GP a permis de déterminer l’agent étiologique dans 93,4% des cas de GEA. Ces résultats ont confirmé dans 83,7% des cas, l’hypothèse diagnostique principale du clinicien et pour 8,1%, cela a engendré une modification du diagnostic. Le FA-GP a aussi permis de faire passer la proportion de patients sortant avant obtention des résultats complet de leur analyse des selles de 54,1% à 7,5%. Sur l’ensemble de l’étude, nous avons obtenu un taux de positivité de 77,5% par le FA-GP, les agents étiologiques majeurs étaient les virus, retrouvés dans 71,4% des échantillons contre 18,7% et 1,1% pour les bactéries et parasites respectivement. L’agent le plus fréquent était le rotavirus (48,3%), suivi du norovirus (14%), puis les E. coli diarrhégéniques (EPEC, EAEC) (13,7%). Les résultats de cette étude montrent que le FA-GP est adapté au diagnostic des GEA en pédiatrie, il est supérieur aux techniques conventionnelles en termes de performances diagnostiques et de rapidité. Au niveau clinique, cette technique apporte un bénéfice en permettant de documenter microbiologiquement la majorité des cas de GEA dans un délai très court, permettant l’instauration d’un traitement, si nécessaire, dans les plus brefs délais. Toutefois, le ciblage des patients et le dialogue clinico-biologique s’avère indispensable afin de faciliter l’interprétation des résultats.

Résumé traduit

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