Comparaison de trois méthodes de qPCR pour le diagnostic de Candidozyma auris
- Candida auris
- qPCR
- PCR en temps réel
- Candidozyma auris
- Candida
- Infections nosocomiales
- PCR quantitative
- Candida auris
- Infection croisée
- Réaction de polymérisation en chaine en temps réel
- Langue : Français
- Discipline : Pharmacie
- Identifiant : 2025ULILE246
- Type de thèse : Doctorat de pharmacie
- Date de soutenance : 15/10/2025
Résumé en langue originale
Candidozyma auris, levure opportuniste identifiée en 2009 au Japon, est devenue fin 2022 un pathogène prioritaire par l’OMS en raison de son implication croissante dans les infections nosocomiales, sa persistance sur la peau et les surfaces en milieu hospitalier et sa multirésistance fréquente aux antifongiques. Sa diffusion mondiale et l’augmentation de son incidence soulignent l’importance d’outils diagnostiques fiables. Ce travail compare trois méthodes de qPCR pour l’identification de C. auris et évalue la sensibilité analytique d’une PCR adaptée dans notre centre. Deux trousses commerciales (RealCycler AURI-UX® de Progenie & FUNGIPLEX® de Bruker) ont été comparées à la PCR maison au moyen de 19 souches appartenant au 5 clades via des dilutions sériées. Les résultats montrent une sensibilité inférieure pour le kit de Bruker, tandis que RealCycler (Progenie) offre de bonnes performances. La PCR maison apparaît comme le meilleur compromis, alliant sensibilité et adaptabilité aux contraintes techniques du CHU de Lille. En parallèle, la méthode Sensititre™ YeastOne™ a été comparée à la méthode de référence qu’est le CLSI. Une légère surestimation des CMI chez certains isolats a été observée, notamment pour le fluconazole et l’amphotéricine B. Ces données suggèrent que la PCR maison est une option fiable et économiquement pertinente pour le diagnostic en routine et que la technique Sensititre pourrait être adaptée en contexte de flambée épidémique sous réserve de validation de la méthode.
- Directeur(s) de thèse : Leroy, Jordan
AUTEUR
- Bourdeyroux, Gabriel

