Titre original :

Comparaison de la PCR en temps réel et de la technologie Lamp pour la détection du génome du Varicella Zoster virus

Mots-clés en français :
  • PCR en temps réel , LAMP , Varicella Zoster virus , biologie moléculaire

  • Diagnostic moléculaire
  • Virus varicelle-zona
  • Techniques de diagnostic moléculaire
  • Herpèsvirus humain de type 3
  • Langue : Français
  • Discipline : Pharmacie. Biologie médicale
  • Identifiant : 2014LIL2E047
  • Type de thèse : Doctorat de pharmacie
  • Date de soutenance : 27/05/2014

Résumé en langue originale

Le diagnostic biologique des infections par le Virus de la Varicelle et du Zona (VZV) repose sur différentes méthodes, parmi lesquelles la biologie moléculaire a pris une place importante. Cette étude réalisée au laboratoire de Virologie du CHRU de Lille avait pour buts de comparer deux kits commerciaux de détection du génome du VZV, l’un basé sur la technologie de la PCR en temps réel et l’autre la technologie LAMP. Les tests ont été effectués sur des échantillons biologiques humains adressés au laboratoire pour le diagnostic d’une infection à VZV et sur des contrôles de qualité ; l’ADN a été extrait grâce à un extracteur automatisé. Les résultats ont été comparés à ceux obtenus avec la technique de PCR utilisée habituellement au laboratoire. Les performances analytiques des deux méthodes étaient comparables et les résultats obtenus étaient cohérents avec ceux obtenus avec la PCR maison. L’extracteur a montré des performances satisfaisantes. Cependant, le kit LAMP semblait présenter un risque de contamination supérieur au cours de la manipulation des extraits d’ADN. La technologie LAMP, récente sur le marché de la biologie moléculaire, est utilisée pour de nombreuses applications à visée agro-alimentaires et humanitaires en raison d’un moindre coût matériel, de la rapidité d’exécution des analyses et de moindres contraintes techniques. Cependant, cette technologie présente moins d’intérêt dans un laboratoire déjà équipé d’automates de biologie moléculaire, et les contraintes techniques du kit LAMP (nombre d’échantillons par série, nombre de tests réalisables par extrait…) sont moins adaptées aux attentes du laboratoire. Le kit LAMP n’a donc pas été retenu pour les besoins du laboratoire, et c’est celui reposant sur la PCR en temps-réel qui a été sélectionné pour le diagnostic de routine des infections par le VZV.

Résumé traduit

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  • Directeur(s) de thèse : Goffard , Anne

AUTEUR

  • Dumetz, Edouard
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