• Langue : Français
• Discipline : Pharmacie. Biologie médicale
• Identifiant : 2021LILUE067
• Type de thèse : Doctorat de pharmacie
• Date de soutenance : 15/06/2021

Résumé en langue originale

La vaccination anti-pertussique des nourrissons introduite dans les années 1990 a réduit en quelques décennies la morbidité infantile de la coqueluche dans le monde. Cependant, des souches mutantes de Bordetella pertussis ont émergé dans plusieurs pays, de virulence plus marquée et/ou de moindre sensibilité à l’immunité vaccinale, et parfois résistantes aux macrolides. Il est donc indispensable de continuer à surveiller les isolats circulants. La culture de B. pertussis essentielle dans cet objectif est malheureusement rarement réalisée, car remplacée pour le diagnostic de coqueluche par une très sensible et spécifique PCR. L’objectif de ce travail était d’obtenir des bactéries en culture à partir d’échantillons destinés à la PCR lorsque celle-ci était positive, puis d’étudier leur diversité par deux techniques innovantes de spectrométrie, masse-MALDI-ToF et infrarouge par transformée de Fourier. Entre novembre 2017 et mars 2019, sur 1 119 échantillons cliniques consécutifs analysés par PCR coqueluche, 84 étaient positifs. Parmi eux, nous avons obtenu 23 isolats en culture, y compris à partir d’échantillons dont la PCR était faiblement positive. Tous étaient sensibles aux macrolides, et 22 sur 23 phylogéniquement proches par les 2 types d’analyse spectrométrique. La technique infrarouge semblait la plus discriminante, et pourrait être un outil rapide et peu coûteux pour différencier les isolats de B. pertussis avant de procéder à leur éventuelle caractérisation épidémiologique complète dans un laboratoire de référence.