Titre original :

Structure et dynamique dans les solutions aqueuses d'urée et d'acétone : étude par simulation de dynamique moléculaire

Mots-clés en français :
  • Fonctions de distribution orientationnelle
  • Structure locale

  • Eau
  • Spectroscopie Raman
  • Fonctions de corrélation
  • Dynamique moléculaire
  • Acétone
  • Urée
  • Protéines
  • Liaisons hydrogène
  • Solutions aqueuses (chimie)
  • Langue : Français
  • Discipline : Instrumentation et analyses avancées
  • Identifiant : 2006LIL10075
  • Type de thèse : Doctorat
  • Date de soutenance : 01/01/2006

Résumé en langue originale

La stabilité et l'activité des molécules biologiques sont liées à la structure et la dynamique de l'eau, du fait des nombreuses liaisons hydrogène que l'eau forme avec celles-ci. L'urée est une molécule organique qui est bien connue pour ses propriétés dénaturantes vis-à-vis des protéines, alors que l'acétone ne présente pas cette particularité. Nous avons étudié par simulation de dynamique moléculaire l'influence de l'urée et de l'acétone sur la structure et la dynamique de l'eau, à l'aide d'observables que nous avons préalablement définies. Nous avons validé les modèles de potentiels d'interaction utilisés dans nos simulations, en comparant les résultats obtenus aux résultats expérimentaux de thermodynamique et de spectroscopies Raman et des neutrons. Nous avons montré par une étude comparative que l'urée induit une plus grande déstructuration du réseau de liaisons hydrogène de l'eau que l'acétone. En particulier, l'urée agit surtout sur la structure locale de l'eau, en perturbant l'orientation des molécules d'eau. Enfin, les deux solutés présentent un effet relativement faible sur la dynamique de l'eau.

  • Directeur(s) de thèse : Vergoten, Gérard - Idrissi, Abdenacer

AUTEUR

  • Cinar, Éric
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