Titre original :

Computational modeling of biomolecular interactions

Titre traduit :

Modélisation d’interactions biomoléculaires

Mots-clés en français :
  • interactions protéines-lipides
  • Interactions protéines-glucides

  • Interactions protéine-protéine
  • Protéines membranaires
  • Dynamique moléculaire
  • Simulation de docking moléculaire
  • Transduction du signal cellulaire
  • ‎Cellules‎ -- Adhésivité
  • Langue : Anglais
  • Discipline : Biologie moléculaire
  • Identifiant : Inconnu
  • Type de mémoire : Habilitation à diriger des recherches
  • Date de soutenance : 06-12-2017

Résumé en langue originale

Alors que les informations concernant les séquences et les structures des différentes molécules biochimiques abondent, celles relatives à leurs interactions demeurent éparses. Les interactions protéines-protéines sont, notamment, des processus clés intervenant dans le fonctionnement de la cellule. En effet, les protéines, impliquées dans la signalisation et la régulation du cycle cellulaire, se lient de manière transitoire à d’autres partenaires protéiques afin de propager le signal, créant ainsi un réseau complexe d’IPPs. Ces processus sont initiés au niveau de la membrane par des protéines membranaires, qui constituent environ 30% de tout le génome. Néanmoins, leur environnement lipidique joue un rôle qui à ce jour n’est que très peu élucidé. De plus, la majorité des protéines sont glycosylées, ce qui leur permette de jouer différents rôles dans l’adhésion cellulaire, l’immunologie, le repliement structural ou encore le contrôle qualité. Mes activités de recherche sont principalement centrées sur la compréhension, en niveau moléculaire, de trois types d’interactions primordiales pour la formation de ces complexes ; à savoir les interactions protéines-lipides, protéines-glucides et protéines-protéines.

Résumé traduit

Whereas both sequence and structure space are being rapidly filled, the sampling of the interactome remains sparse. Protein-protein interaction (PPI) is one of the key processes in cellular functioning. Proteins involved in cellular signaling and regulation transiently bind other proteins to propagate a signal, thereby forming an intricate network of PPIs. These processes are initiated at the membrane surface and a significant portion of proteins in the cell are membrane-associated, accounting for as much as 30% of all genomic sequences. But their lipidic environment plays a role that is to-date poorly understood. In addition, the majority of proteins are glycosylated, with glycosylation playing such diverse roles as in cellular adhesion, immunology, and protein folding and quality control. My main research activities are aimed towards the understanding at the molecular level of three types of fundamental interactions governing these protein complexes, namely (i) protein-lipid interaction, (ii) protein-carbohydrate interaction and (iii) protein-protein interaction.

  • Directeur(s) de thèse : Blossey, Ralf
  • Laboratoire : Unité de glycobiologie structurale et fondamentale (UGSF)
  • École doctorale : École doctorale de Biologie-Santé (Lille)

AUTEUR

  • Lensink, Marc F.
Droits d'auteur : Ce document est protégé en vertu du Code de la Propriété Intellectuelle.
Accès libre