Titre original :

Contribution of comparative genomics to the study of algae storage polysaccharides metabolism

Titre traduit :

Application de la génomique comparative a l’étude du métabolisme des polysaccharides de réserve chez les eucaryotes

Mots-clés en français :
  • Polysaccharides de réserve
  • Enzymes du métabolisme des sucres

  • Amidons
  • Algues
  • Endosymbiose
  • Glycosidases
  • Transcription génétique
  • Transfert génétique
  • Langue : Anglais
  • Discipline : Biologie
  • Identifiant : Inconnu
  • Type de mémoire : Habilitation à diriger des recherches
  • Date de soutenance : 27/09/2013

Résumé en langue originale

Ces dernières années notre compréhension de l’évolution des eucaryotes a fortement progressé, car une série de génomes représentant un large nombre des taxons sont devenus disponibles (parasites apicomplexes, amibes, ciliés, algues rouges et vertes, parabasalides, oomycètes, diatomées, diplomonades). L’acquisition de la séquence génomique des Rhodophyceae (algues rouges), des Chloroplastida (algues vertes et plantes terrestres) ainsi que le génome de Cyanophore paradoxe, une des rares espèces de glaucophytes (algues unicellulaires d’eau douce), a contribué à établir de manière définitive l’hypothèse, jusque là non démontrée, de la monophylie des Archaeplastida (Glaucophyta, Rhodophyceae, Chloroplastida). On distingue chez lez eucaryotes deux sortes des polysaccharides de réserve, des α-glucanes, et des ß-glucanes. Ils existent deux types majoritaires des α-glucanes, l’amidon et le glycogène. L’amidon ne s’accumule que chez les Archaeplastida (eucaryotes photosynthétique issus de l’endosymbiose plastidiale) ou chez certains organismes qui en sont dérivés par endosymbiose secondaire (parasites apicomplexes, dinoflagellés, cryptophytes). Tous les autres eucaryotes hétérotrophes lorsqu’ils accumulent des α-glucanes comme polysaccharides de réserves synthétisent du glycogène hydrosoluble et non de l’amidon semi-cristallin et insoluble. Ce dernier constitue donc une «signature» de l’endosymbiose plastidiale et l’étude de son histoire évolutive revêt un grand intérêt L’objectif de l’équipe génétique microbienne dirigée par le PR Steven Ball est de comprendre comment les réseaux métaboliques des différents partenaires se sont imbriqués pour conduire à la synthèse de polysaccharides de réserves semi-cristallins. Les activités de recherche de l’équipe s’articulent sur deux axes complémentaires: l’étude de l’histoire évolutive du métabolisme de l’amidon et l’analyse fonctionnelle des enzymes impliquées dans cette voie métabolique. Mes compétences sur l’analyse comparative des enzymes du métabolisme des sucres (CAZymes) encodées par des différents génomes eucaryotes apportent à l’équipe de génétique microbienne des compétences complémentaires pour l’étude de leur implication dans l’évolution du métabolisme des polysaccharides de réserve. Mon projet de recherche à moyenne terme vise à caractériser des réseaux transcriptomiques chez les eucaryotes, pour étudier les patterns récurrents à fin d’identifier des régulateurs globaux conservés dans la course de l’évolution.

  • Directeur(s) de thèse : Ball, Steven
  • Laboratoire : Unité de glycobiologie structurale et fondamentale (UGSF)
  • École doctorale :

AUTEUR

  • Arias, Maria Cecilia
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