Développements en imagerie par spectrométrie de masse MALDI et applications aux problématiques biologiques
- matrices ioniques
- Protéines
- Réactions de fragmentation
- ARN messagers
- Échantillonnage
- Tissus (histologie)
- Langue : Français
- Discipline : Sciences naturelles
- Identifiant : Inconnu
- Type de mémoire : Habilitation à diriger des recherches
- Date de soutenance : 01/01/2005
Résumé en langue originale
L imagerie par spectrométrie de masse MALDI est une technologie actuellement en plein essor. Elle permet d obtenir rapidement en une seule étape d'acquisition, la répartition moléculaire de différents composés (en particulier les peptides/protéines) présents dans un tissu, en s'affranchissant des étapes longues et coûteuses en échantillons liées aux extractions et séparations habituellement nécessaires par les techniques classiques. Cependant, afin d'augmenter encore la potentialité de cette technologie, des développements restent encore à effectuer. Les recherches menées ont donc plus particulièrement porté sur le traitement et la préparation de l'échantillon en vue de l'analyse directe et l'imagerie par MALDI, ainsi que des développements instrumentaux permettant d'augmenter la résolution spatiale. Dans ce contexte de nouvelles matrices, de type matrices ioniques, se sont révélées particulièrement adaptées aux tissus en permettant d obtenir une plus grande intensité du signal, un plus grand nombre de composés détectés, de bonnes performances en mode négatif, une grande homogénéité de cristallisation, une grande stabilité sous vide et une faible ablation de matériel consécutivement à l'irradiation laser. Le traitement préalable des tissus permet également une amélioration de la qualité spectrale et des performances d'études structurales en mode MS/MS, tout comme les traitements des tissus par des solvants organiques et les digestions enzymatiques et en particulier pour les tissus conservés en blocs de paraffine après fixation. Enfin, la résolution spatiale des images peut être améliorée pour atteindre la taille d'une cellule en développant des systèmes de masques de dimensions bien définies. L'étude de la répartition des ARNm au sein des tissus est un développement crucial afin d obtenir des images de colocalisation transcriptome/protéome. Pour répondre à cette problématique, un nouveau concept permettant de réaliser de telles images a été développé. Celui-ci est basé sur une analyse indirecte des ARNm, au travers de l'utilisation d un groupement photoclivable relié à un peptide marqueur de séquence connue qui sera détecté, après hybridation sur le tissu d une sonde oligonucléotidique portant ce marqueur. Enfin, l ensemble de ces développements trouve de nombreuses applications dans le domaine de la biologie et notamment dans le cadre de pathologies tel que le cancer de l' ovaire.
- Directeur(s) de thèse : Salzet, Michel
AUTEUR
- Fournier, Isabelle