Université Lille1 - Sciences et Technologies Structures combinatoires pour l'analyse de génomes ARN -- Structure secondaire Algorithmes prédictifs 572.801 13 Matrices Arbres (théorie des graphes) Transcription génétique Informatique Réécriture, Systèmes de (informatique) Séquence nucléotidique Informatique Bioinformatique Text Electronic Thesis or Dissertation fr Le cœur de ce travail est le développement d'algorithmes pour l'analyse de séquences nucléiques. Le terme " séquence nucléique " recouvre des objets biologiques disparates. Il peut s'agir de gènes codant pour des protéines, mais ce n'est qu'une partie du matériel génétique. Les projets de séquençage invitent à dépasser ce cadre de pensée et permettent d'accéder à l'étude systématique des régions non codantes. Nous abordons ce problème à travers deux thèmes: les structures des ARN et de l'analyse des régions régulatrices. D'un point de vue informatique, ces directions de recherche ont en commun de faire appel à des modélisations à base de structures discrètes. Il s'agit de combinatoire des arbres dans le cas des structures d'ARN et de combinatoire des mots dans le cas des signaux de régulation. Nous proposons des nouveaux algorithmes de comparaison et de prédiction de structures d'ARN, de localisation et d'identification de motifs de régulation. Ces travaux sont validés par différentes études de cas. application/pdf 1 : 1 Mo https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/HDR/2004/50376-2004-305.pdf Touzet Hélène 1900-01-01 10394074X 2004-01-01 Sciences mathématiques. Informatique Université Lille1 - Sciences et Technologies 026404184 HDR non oui Dauchet Max 110327969 ddc:570 ASCII PDF 9999 restriction 2012-01-01 9999-01-01 restriction 2012-01-01 9999-01-01