Note ABES Apports des données omiques dans la caractérisation de l'hétérogénéité tumorale des tumeurs neuroendocrines pancréatiques Contributions of Omics Data to the Characterization of Tumor Heterogeneity in Pancreatic Neuroendocrine Tumors Tumeur neuroendocrines pancréatiques Metabolisme Métabolomique Transcriptomique MEN1 YAP BCL2 HER2 Sous-types moléculaires Biomarqueurs Pancreatic neuroendocrine tumors Metabolism Metabolomics Transcriptomics MEN1 YAP BCL2 HER2 Molecular subtypes Biomarkers Pancréas Tumeurs Transcriptome Résistance aux médicaments Marqueurs biologiques Métabolisme Gène BCL-2 Gène HER-2 Classification moléculaire (médecine) Tumeurs du pancréas Transcriptome Résistance aux substances Marqueurs biologiques Métabolisme Gènes bcl-2 Gènes erbB-2 Récepteur ErbB-2 Introduction - Les tumeurs neuroendocrines pancréatiques (TNEPs) représentent un groupehétérogène avec des options thérapeutiques limitées en termes d’efficacité et un manque debiomarqueurs pronostiques ou prédictifs fiables. Ce travail vise à caractériser les altérationsmétaboliques et transcriptomique des TNEPs afin d'identifier de nouveaux marqueursdiagnostiques et des cibles thérapeutiques.Méthodes - Nous avons réalisé des analyses transcriptomiques in silico et métabolomiquesplasmatiques sur une cohorte de 76 patients atteints de TNEP que nous avons comparés à destémoins. En outre, nous avons réalisé une analyse des réseaux de régulations transcriptomiquesà partir de 63 tissus de TNEPs pour établir une classification basée sur les réseaux de régulationdes facteurs de transcription et définir de nouvelles cibles thérapeutiques.Résultats - L'analyse métabolomique a révélé des altérations significatives des voies desphosphoglycérides et de l'oxydation des acides gras chez les patients atteints de TNEPs. Destaux élevés d'acide glutamique étaient associés à une extension métastatique, tandis que lespatients porteurs de mutations MEN1 présentaient des signatures métabolomiques distinctesimpliquant le métabolisme des acides aminés et la biosynthèse des lipides. Nous avons établides signatures métabolomiques performantes, particulièrement pour les TNEPs mutées MEN1.L'analyse des réseaux transcriptomiques a permis l’identification de trois clusters distincts : lecluster 1 était enrichi en mutations MEN1 ; le cluster 3 contenait davantage de formessécrétantes de TNEPs ; et le cluster 2 présentait des caractéristiques plus agressives liées àl'infiltration stromale et à l'activation de molécules constituant des cibles thérapeutiques commeYAP, BCL2 et HER2.Conclusion - Notre travail permet d’appréhender les altérations métaboliques des TNEPs etidentifie trois sous-types transcriptomiques avec des caractéristiques moléculaires et cliniquesdistinctes. Ces résultats soulignent le rôle critique de la reprogrammation métabolique dansl’oncogenèse des TNEPs et identifient de potentiels nouveaux biomarqueurs et ciblesthérapeutiques qui pourraient améliorer la prise en charge des patients. Introduction - Pancreatic neuroendocrine tumors (pNETs) represent a heterogeneous group ofneoplasms with limited therapeutic options and a lack of reliable prognostic or predictivebiomarkers. This work aimed to comprehensively characterize the metabolic and transcriptomiclandscape of pNETs to identify novel diagnostic markers and therapeutic targets.Methods: We employed in silico analysis and plasma metabolomic profiling to comparemetabolic alterations between pNET patients and non-cancerous individuals. Additionally, weperformed transcriptomic analyzed based on gene regulatory network in a cohort of 63 pNETsto identify molecular subtypes and new therapeutic tools.Results - Metabolomic analysis revealed significant alterations in phosphoglyceridemetabolites and fatty acid oxidation pathways in pNET patients. Elevated glutamic acid levelswere associated with metastatic disease, while patients with MEN1 mutations displayed distinctmetabolic signatures involving amino acid metabolism and lipid biosynthesis. We establishedmetabolomic signatures with high diagnostic accuracy, particularly for MEN1-mutated pNETs.Transcriptomic network analysis identified three distinct clusters: Cluster 1 was enriched forMEN1 mutations; Cluster 3 contained more functional forms of pNETs; and Cluster 2 exhibitedmore aggressive characteristics related to stromal infiltration and activation of targetablemolecules such as YAP, BCL2, and HER2.Conclusion - Our work provides the first comprehensive overview of metabolic alterations inpNETs and identifies three transcriptomic subtypes with distinct molecular and clinicalcharacteristics. These findings highlight the critical role of metabolic reprogramming in pNETpathogenesis and identify potential novel biomarkers and therapeutic targets that could improvepatient management. Larger cohort studies will be necessary to validate these results.. Electronic Thesis or Dissertation Text Image en PDF 77062022 https://pepite-depot.univ-lille.fr/ Metabolism of pancreatic neuroendocrine tumors: what can omics tell us? Arnaud Jannin Anne-Frédérique Dessein Christine Do Cao Marie-Christine Vantyghem Frontiers en 2023 Text Identification of metabolite biomarkers for pancreatic neuroendocrine tumours using a metabolomic approach Arnaud Jannin Sophie Dabo-Niang Christine Do Cao Amandine Descat Oxford Academic en 2025 Text Jannin Arnaud 1988-02-24 FR 23642565X 1499024412L 142609 https://theses.fr/2025ULILS050 2025ULILS050 https://doi.org/10.70675/48547a12zf3e0z4886z9fe0z44efa210c898 2025-06-06 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Université de Lille (2022-....) 259265152 Doctorat Docteur es oui oui Jonckheere Nicolas MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 094282153 Coppin Lucie MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 165711043 Vantyghem Marie-Christine MADS_PRESIDENT_DU_JURY 070301468 Walter Thomas MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 092396003 Hadoux Julien MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 198092369 Van Seuningen Isabelle MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 094282048 Barlier Anne MADS_RAPPORTEUR_1 143313339 Gibert Benjamin MADS_RAPPORTEUR_2 164111530 École doctorale Biologie-Santé MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 446 147705126 Hétérogénéité, plasticité et résistance aux thérapies des cancers (CANTHER) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 1366 249814935 ddc:610 Jonckheere Nicolas Coppin Lucie Vantyghem Marie-Christine Walter Thomas Hadoux Julien Van Seuningen Isabelle Barlier Anne Gibert Benjamin École doctorale Biologie-Santé Hétérogénéité, plasticité et résistance aux thérapies des cancers (CANTHER) PDF 77062022 confidentialité 2025-06-06 2026-12-31 confidentialité 2025-06-06 2026-12-31 confidentialité 2025-06-06 2026-12-31