Note ABES Caractérisation des bases moléculaires du sucrage induit par le froid chez la pomme de terre Solanum tuberosum Caracterization of the molecular basis of cold-induced sweetening in potato Solanum tuberosum Sucrage induit par le froid Protéomique Amélioration variétale Potato Cold-Induced sweetening Proteomics Métabolomique Plant breeding Starch Pommes de terre Stockage Teneur en glucides Effets du froid Protéomique Métabolomique Pomme de terre -- Variétés Résistance au froid Amidon de pomme de terre Le stockage des pommes de terre à basse température entraîne une accumulation de sucres solubles réducteurs, un phénomène connu sous le nom de Cold-Induced Sweetening (CIS). Ce processus est problématique car ces sucres participent à la formation de composés indésirables, comme l'acrylamide, ou de composés colorés lors de la cuisson à haute température. Toutefois, toutes les variétés de pommes de terre ne réagissent pas de la même manière face au stockage au froid et les mécanismes expliquant cette variabilité restent mal compris et plusieurs voies métaboliques sont impliquées .Afin de mieux comprendre ce phénomène, une approche sans a priori combinant la métabolomique et la protéomique a été développée. L'objectif est de détecter un maximum de composés dans les tubercules avant et après la mise au froid, dans des variétés ayant des réponses différentes au froid afin d'identifier des biomarqueurs permettant de prédire les leur comportement ou d'expliquer un CIS plus ou moins marqué.Dans ce cadre, nous avons développé un modèle intégratif multi-omique, capable de croiser les données issues des différentes données omiques. Grâce à ce modèle, nous avons pu distinguer des signatures moléculaires associées à la tolérance ou à la sensibilité au CIS.Parmi les résultats les plus notables, des protéines de tolérance à différents stress ont été identifiées dans certaines variétés, et ce même avant la mise au froid. Cette découverte suggère que ces protéines constituent des biomarqueurs précoces de la tolérance au CIS. Les analyses effectuées avant et après mise au froid ont permis d'identifier des cibles potentielles pour une mutagénèse afin d'observer le rôle de ces protéines et leur impact sur le CIS. The storage of potatoes at low temperatures leads to the accumulation of soluble reducing sugars, a phenomenon known as Cold-Induced Sweetening (CIS).This process is problematic because these sugars contribute to the formation of undesirable compounds, such as acrylamide, or colored compounds during high-temperature cooking. However, not all potato varieties respond in the same way to cold storage, and the mechanisms underlying this variability remain poorly understood.In order to understand this phenomenon, an untargeted approach combining metabolomics and proteomics was developed. The goal is to detect as many compounds as possible in the tubers before and after cold storage, in varieties showing different responses to cold, in order to identify biomarkers that could predict their behavior or explain a more or less pronounced CIS.In this context, we developed an integrative multi-omics model capable of combining data from different omics analyses. Using this model, we were able to distinguish molecular signatures associated with tolerance or sensitivity to CIS.Among the most notable results, stress-tolerance proteins were identified in certain varieties, even before cold exposure. This discovery suggests that these proteins could serve as early biomarkers of CIS tolerance. Analyses performed before and after cold storage also allowed us to identify potential targets for mutagenesis to investigate the role of these proteins and their impact on CIS. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 17322523 https://theses.fr/2025ULILR065/abes Otuszewski Pierre Otuszewski 1999-01-19 FR 296821829 https://theses.fr/2025ULILR065 2025ULILR065 https://doi.org/10.70675/4acf5973z617fz4835z8808z4185c9acde79 2025-12-11 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Université de Lille (2022-....) 259265152 Doctorat Docteur es non oui Mazzah Ahmed MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 032931166 Hulst Christophe D' MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 061175447 Bray Fabrice MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_3 226852709 Szydlowski Nicolas MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_4 124932835 Castignolles Patrice MADS_PRESIDENT_DU_JURY 07656780X Schaeffer-Reiss Christine MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 12762998X Gagneul David MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 09642799X Afonso Carlos MADS_RAPPORTEUR_1 089578961 Alves Sandra MADS_RAPPORTEUR_2 069729654 École doctorale Sciences de la matière, du rayonnement et de l'environnement (Lille ; 1992-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 148937330 Miniaturisation pour la synthèse, l'analyse et la protéomique (MSAP) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 161610153 Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (Villeneuve d'Ascq ; 1998-....) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_2 134442571 Hauts-de-France. Conseil régional MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_3 203650891 Agence nationale de la recherche (France ; 2005-....) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_4 121892174 ddc:570 Mazzah Ahmed Hulst Christophe D' Bray Fabrice Szydlowski Nicolas Castignolles Patrice Schaeffer-Reiss Christine Gagneul David Afonso Carlos Alves Sandra École doctorale Sciences de la matière, du rayonnement et de l'environnement (Lille ; 1992-....) Miniaturisation pour la synthèse, l'analyse et la protéomique (MSAP) Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (Villeneuve d'Ascq ; 1998-....) Hauts-de-France. Conseil régional Agence nationale de la recherche (France ; 2005-....) PDF 17322523 confidentialité 2025-12-11 2028-01-31 confidentialité 2025-12-11 2028-01-31 confidentialité 2025-12-11 2028-01-31 confidentialité 2025-12-11 2028-01-31