Note ABES De l'étude du rôle des miARN dans la physiopathologie de l'infection par le SARS-CoV-2 à l'élaboration d'une application clinique From studying the role of miRNAs in the pathophysiology of SARS-CoV-2 infection to developing a clinical application MiARN SARS-CoV-2 Physiopathologie virale Diagnostics Effet antiviral Nanomatériaux Biologie Virologie MiRNA SARS-CoV-2 Viral pathophysiology Diagnostics Antiviral effect Nanomatérials Biology Virology SARS-CoV-2 (virus) Physiopathologie Covid-19 Physiopathologie MicroARN Nanostructures SARS-CoV-2 physiopathologie COVID-19 physiopathologie microARN Nanostructures Le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, SARS-CoV-2), de la famille Coronaviridae, est responsable de la maladie à coronavirus de 2019 (coronavirus disease 2019, COVID-19). Malgré la disponibilité de vaccins, en cause dans la fin de l’urgence sanitaire de la COVID-19, la circulation virale du SARS-CoV-2 subsiste ainsi que les recherches sur la compréhension de sa physiopathologie, notamment l’implication et le rôle des microARN (miARN) dans cette infection virale. Les miARN sont des petits ARN non codants régulant l’expression des gènes et connus pour leurs implications dans de nombreuses voies de régulation cellulaire. Récemment, ils se sont révélés l’être également dans l’infection par le SARS-CoV-2. Ces recherches permettraient une meilleure connaissance dans ce domaine et pourraient s’avérer utiles dans le développement de nouveaux diagnostics et de traitements cliniques contre cette infection virale ou d’autres infections de la même famille virale. Ainsi, dans ce projet de recherche, nous avons d’abord caractérisé les miARN cellulaires biomarqueurs de l’infection virale par le SARS-CoV-2 à partir de prélèvements nasopharyngés de patients, qui est le prélèvement recommandé pour le diagnostic de cette infection virale. Nos travaux ont identifié en particulier, des miARN associés à des formes sévères de la COVID-19. Ces derniers ciblent des gènes impliqués dans les infections virales et les réponses antivirales et anti-inflammatoires aux infections virales. Ces potentiels effets antiviraux et anti-inflammatoires des miARN sur l’infection virale par le SARS-CoV-2 n’ont pas pu être démontrés in vitro lors de cette étude. Par la suite, on s’est penché sur l’hypothèse de la dérégulation de la biogénèse des miARN par cette infection virale. On a trouvé aucune sous-expression des ARNm des gènes impliqués de la voie de biogénèse des miARN lors de l’infection par le SARS-CoV-2, que ce soit en ex vivo ou en in vitro. Pour finir, nous avons voulu développer un possible traitement clinique contre l’infection virale par le SARS-CoV-2 ou tout autre pathologie par la délivrance de miARN d’intérêt. Il s’agirait de développer des nanoparticules et des nanomatériaux couplés à des miARN ou autres ARN doubles brins messagers ou non, afin de permettre l’entrée de ces derniers au sein des cellules et rétablir ainsi l’expression basale des gènes impliqués dans l’infection virale. Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 (SARS-CoV-2), a member of the Coronaviridae family, is responsible for coronavirus disease 2019 (COVID-19). Despite the availability of vaccines that helped end the COVID-19 health emergency, the viral circulation of SARS-CoV-2 remains, as well as research on the understanding of its pathophysiology, in particular the involvement and role of microRNAs (miRNAs) in this viral infection. miRNAs are small non-coding RNAs that regulate gene expression and are known to be involved in numerous cellular regulatory pathways. Recently, they have also been shown to be involved in SARS-CoV-2 infection. Such research would provide a better knowledge in this field and could be useful in the development of new diagnoses and clinical treatments against viral infection with SARS-CoV-2 or other infections of the same viral family. Thus, in this research project, we first characterized the cellular miRNA biomarkers of SARS-CoV-2 viral infection from patient nasopharyngeal swabs, which is the first diagnostic tool for this viral infection. In particular, our work has identified miRNAs associated with severe forms of COVID-19. These miRNA target genes involved in viral infections and antiviral and anti-inflammatory responses to viral infections. These potential antiviral and anti-inflammatory effects of miRNAs on SARS-CoV-2 viral infection could not be demonstrated in vitro in this study. Then, the hypothesis of deregulation of miRNA biogenesis by this viral infection was investigated. No under-expression of mRNAs of genes involved in the miRNA biogenesis pathway was found upon infection with SARS-CoV-2, either ex vivo or in vitro. Finally, based on a miRNA of clinical interest, we wanted to develop a possible clinical treatment against viral infection by SARS-CoV-2 or any other pathology through the delivery of miRNAs of interest, in this case antiviral. This would involve developing nanoparticles and nanomaterials coupled to miRNAs or other double-stranded messenger or non-messenger RNAs, to enable the latter to enter cells and thus restore basal expression of the genes involved in viral infection. Electronic Thesis or Dissertation Text Image fr PDF 7021295 Garnier Nathalie 1997-09-26 FR 281675880 0108026862C 135019 https://theses.fr/2024ULILS035 2024ULILS035 https://doi.org/10.70675/921d3ae5za35dz4c34za19ez332dd8190127 2024-10-28 Sciences de la vie et de la santé Université de Lille (2022-....) 259265152 Doctorat Docteur es non oui Engelmann Ilka MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 190927976 Szunerits Sabine MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 097506362 Ritzenthaler Christophe MADS_PRESIDENT_DU_JURY 112137180 Pichon Chantal MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 10692396X Fourati Slim MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 166879576 Pichon Chantal MADS_RAPPORTEUR_1 10692396X Fourati Slim MADS_RAPPORTEUR_2 166879576 École graduée Biologie-Santé (Lille ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 446 147705126 Pathogenèse virale du diabète de type 1 (Lille) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 3610 191055115 ddc:570 Engelmann Ilka Szunerits Sabine Ritzenthaler Christophe Pichon Chantal Fourati Slim Pichon Chantal Fourati Slim École doctorale Biologie-Santé (Lille ; 2000-....) Pathogenèse virale du diabète de type 1 (Lille) PDF 7021295 confidentialité 2024-10-28 2029-09-30 confidentialité 2024-10-28 2029-09-30 confidentialité 2024-10-28 2029-09-30