Note ABES Déterminisme moléculaire des anomalies radiales Molecular determinism of radial dysplasia Dysplasie radiale Syndrome de Holt-Oram Syndrome de Blackfan-Diamond TBX5 RPL26 RPL17 Développement des membres Caractérisation fonctionnelle Radial Defect Holt-Oram syndrome Diamond-Blackfan syndrome TBX5 RPL26 RPL17 Limb development Functional characterization Maladies rares Diagnostic Membre supérieur Malformations Génétique Syndrome de Holt-Oram Génétique Facteurs de transcription Ribosomes Séquençage à haut débit Génome humain Introns Variants génétiques de signification inconnue Maladies rares diagnostic Anomalies morphologiques congénitales du membre supérieur diagnostic Anémie de Blackfan-Diamond Protéines à domaine boîte-T Facteurs de transcription Sous-unités du ribosome Séquençage nucléotidique à haut débit Génome humain Introns Techniques in vitro L’identification d’une cause moléculaire est cruciale pour la prise en charge des patients présentant une anomalie radiale, notamment du fait des possibles atteintes associées. Ici, nous présentons, pour contextualiser, une revue de la littérature sur les étiologies des anomalies radiales et les interactions entre la biologie fondamentale et la pathologie humaine dans ce domaine. Puis, nous développons l’une des étiologies monogéniques les plus fréquentes d’anomalies radiales, le syndrome de Holt-Oram, lié aux altérations du gène TBX5, afin d’en préciser les critères diagnostiques, à partir d’une large cohorte de patients. Plusieurs variants faux-sens et d’épissage de TBX5 identifiés à partir de cette étude, puis de l’étude de la littérature, étaient de signification incertaine. Nous présentons les résultats de tests fonctionnels de ces variants, comprenant notamment un variant gain-de fonction responsable d’un phénotype atypique et un variant intronique profond responsable de l’incorporation d’un pseudo-exon décalant le cadre de lecture. Enfin, pour les patients présentant une anomalie radiale bilatérale isolée, en errance diagnostique après étude des gènes impliqués dans les malformations des membres, nous présentons les résultats d’étude de génome entier. Nous avons identifié, chez 5 patients d’une famille française, un variant causal, situé dans une région non-codante du gène RPL26, impliqué dans le syndrome de Blackfan-Diamond, décrit dans une seule famille jusqu’à présent. Grâce à un appel à collaboration, nous présentons les phénotypes associés aux variants de RPL26 dans 3 autres familles. Par ailleurs, nous discutons un variant homozygote de RPL17 identifié chez une patiente issue d’une union consanguine, pour lequel des études fonctionnelles sont envisagées. Nos travaux illustrent la place du séquençage de génome dans le diagnostic étiologique des malformations des membres et l’importance des collaborations interdisciplinaires et internationales dans ce domaine. Molecular determinism is crucial for the management of patients presenting with a radial defect, in particular because of the possible associated features. Here, we introduce the topic presenting a literature review of the etiology of radial defects and the relationship between fundamental biology and human disease in this field. Then, we report a large cohort of patients with Holt-Oram syndrome, one of the most common monogenic cause of radial defect, caused by TBX5 gene variants, in order to establish the diagnostic criteria for this rare disease. Some of the identified TBX5 missense or splice variants in this series, and in the literature, were of uncertain significance. We present the results of functional assays for these variants, including a gain-of-function variant responsible for an atypical phenotype and a deep intronic variant responsible for the incorporation of a pseudo-exon leading to frame-shifting. Finally, we present the results of whole genome sequencing in patients presenting with isolated and bilateral radial defects, and without a molecular diagnosis after targeted high-throughput sequencing of genes involved in limb development. A non-coding causal variant in RPL26 gene, that had been previously reported in only one family with Diamond-Blackfan syndrome, was identified in 5 related patients of one family of our cohort. Thanks to a call of collaboration, we present the phenotype associated to RPL26 variants in 3 additional families. Finally, we discuss a homozygous RPL17 missense variant identified in a girl born from consanguineous parents, for which functional assays are planned. Our work illustrates the role of genome sequencing as etiological diagnostic tool for limb malformations and the importance of interdisciplinary and international collaborations in this field. Electronic Thesis or Dissertation Text Image fr en PDF 9234286 https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/EDBSL/2024/2024ULILS029.pdf https://theses.hal.science/tel-05305319 https://theses.fr/2024ULILS029/abes https://theses.hal.science/tel-05305319 https://theses.hal.science/tel-05305319 https://theses.hal.science/tel-05305319 Holt-Oram syndrome: clinical and molecular description of 78 patients with TBX5 variants Clémence Vanlerberghe Anne-Sophie Jourdain Jamal Ghoumid Frédéric Frenois Aurélie Mezel Guy Vaksmann Bruno Lenne Bruno Delobel Nicole Porchet Valérie Cormier-Daire Thomas Smol Fabienne Escande Sylvie Manouvrier-Hanu Florence Petit Nature Publishing Group fr 2018 Text Functional characterization vs in silico prediction for TBX5 missense and splice variants in Holt-Oram syndrome Clémence Vanlerberghe Anne-Sophie Jourdain Frédéric Frenois Emilie Ait-Yahya Mike Bamshad Anne Dieux William Dufour Fiona Leduc Sylvie Manouvrier-Hanu Karynne Patterson Jamal Ghoumid Fabienne Escande Thomas Smol Perrine Brunelle Florence Petit Elsevier en 2024 Text RPL26 variants: A rare cause of Diamond-Blackfan anemia syndrome with multiple congenital anomalies at the forefront Clémence Vanlerberghe Frédéric Frenois Thomas Smol Anne-Sophie Jourdain Fabienne Escande Emilie Ait-Yahya Abdulrahman A Aldeeri Timothy W Yu Valérie Cormier-Daire Jamal Ghoumid Maureen Jacob Ruth Newbury-Ecob Sylvie Manouvrier Jessica Platon Sebastian Sailer Perrine Brunelle Lydie Da Costa Florence Petit Elsevier en 2024 Text Vanlerberghe Clémence 1985-08-10 FR 19042091X 1700105820J 119621 https://theses.fr/2024ULILS029 2024ULILS029 https://doi.org/10.70675/a5f0357fz2f31z42ddz821ez7186a854b335 2024-10-08 Biochimie et biologie moléculaire Université de Lille (2022-....) 259265152 Doctorat Docteur es oui oui Petit Florence MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 13160189X Nicolas Gaël MADS_PRESIDENT_DU_JURY 165828412 Holder-Espinasse Muriel MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 114027765 Manouvrier Sylvie MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 073675105 Nicolas Gaël MADS_RAPPORTEUR_1 165828412 Fitoussi Franck MADS_RAPPORTEUR_2 074433199 École graduée Biologie-Santé (Lille ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 446 147705126 Maladies rares du développement embryonnaire et du métabolisme : du phénotype au génotype et à la fonction RADEME (Lille) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 7364 225665085 Maladies RAres du DEveloppement embryonnaire et du MEtabolisme : du Phénotype au Génotype et à la Fonction - ULR 7364 MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_2 497295 ddc:570 Petit Florence Nicolas Gaël Holder-Espinasse Muriel Manouvrier Sylvie Nicolas Gaël Fitoussi Franck École graduée Biologie-Santé (Lille ; 2000-....) Maladies rares du développement embryonnaire et du métabolisme : du phénotype au génotype et à la fonction RADEME (Lille) Maladies RAres du DEveloppement embryonnaire et du MEtabolisme : du Phénotype au Génotype et à la Fonction - ULR 7364 PDF 9234286