Note ABES Activité antifongique de lipopeptides de Bacillus subtilis sur une souche de Venturia inaequalis (tavelure du pommier) de sensibilité réduite aux triazoles : contribution à la compréhension du mode d'action Antifungal activity of Bacillus subtilis lipopeptides on a strain of Venturia inaequalis (apple scab) with reduced sensitivity to triazoles : contribution to understanding the mode of action Venturia Inaequalis Bacillus spp Tavelure du pommier Lipopeptides Triazoles Mécanismes de résistance Fengycine Venturia inaequalis Bacillus spp Apple scab Lipopeptides Triazoles Resistance mechanisms Venturia inaequalis Lutte contre Tavelure du pommier Lipopeptides Bacillus (bactéries) Triazoles Résistance aux fongicides La lutte contre la tavelure du pommier due à Venturia inaequalis, une maladie préjudiciable, nécessite des alternatives aux fongicides chimiques conventionnels plus respectueuses de l'environnement. Une possibilité prometteuse est l'utilisation de lipopeptides produits par différentes espèces de Bacillus. Un des objectifs de ce travail a été d'évaluer l'efficacité de trois familles de lipopeptides (fengycines, iturines et surfactines) et de leurs mélanges pour lutter contre V. inaequalis, tant in vitro qu'in vivo. Il s'est basé sur une souche de V. inaequalis sensible au tébuconazole (S755) et une souche ayant une sensibilité réduite au tébuconazole (Rs552) qui présentent également une résistance différenciée à la fengycine avec pour objectif d'approfondir la compréhension des mécanismes responsables de cette différence de sensibilité à ces deux molécules antifongiques. Contrairement à la fengycine, les lipopeptides de la famille des iturines ont une activité similaire sur les deux souches, alors que ceux de la famille des surfactines ne sont pas actifs, sauf en mélange binaire avec la fengycine. Les mélanges de fengycine/surfactine 50-50% et de mycosubtiline/surfactine 80-20% sont aussi efficaces que les lipopeptides seuls in vitro. A partir de ces mélanges, des essais en vergers ont montré une réduction significative de l'incidence de la tavelure pouvant aller jusqu'à 70%. Les différences de sensibilités ont été investiguées en utilisant des techniques de biologie moléculaire, de microscopie et de lipidomique. Les différences de sensibilités aux triazoles sont liées à des mécanismes moléculaires distincts, incluant la surexpression du gène Cyp51A et un efflux accru par des pompes membranaires chez la souche Rs552. Alors que ces mécanismes ne semblent pas impliqués dans la sensibilité réduite à la fengycine. Les observations microscopiques indiquent des altérations cellulaires induites par celle-ci, suggérant une interaction avec les membranes plasmiques. Les analyses lipidiques révèlent quelques variations dans la composition en stérols et acides gras totaux ainsi qu'en phospholipides entre les souches, pouvant influencer leur sensibilité à la fengycine. En conclusion, l'efficacité potentielle des lipopeptides produits par Bacillus comme alternative aux fongicides chimiques dans la lutte contre la tavelure du pommier a été mis en lumière. The fight against apple scab caused by Venturia inaequalis, a harmful disease, requires more environmentally friendlier alternatives to conventional chemical fungicides. One promising possibility is the use of lipopeptides produced by various Bacillus species. One of the objectives of this work was to evaluate the efficacy of three families of lipopeptides (fengycins, iturins and surfactins) and their mixtures in controlling V. inaequalis, both in vitro and in vivo. The project was based on a V. inaequalis strain sensitive to tebuconazole (S755) and a strain with reduced sensitivity to tebuconazole (Rs552), which also exhibit differential resistance to fengycin, with the aim of deepening the understanding of the mechanisms responsible for this difference in sensitivity to these two antifungal treatments. Unlike fengycin, lipopeptides from the iturin family have a similar activity on both strains, while those from the surfactin family are not active, except in binary mixtures with fengycin. Mixtures of fengycin/surfactin 50-50% and mycosubtilin/surfactin 80-20% are as effective as individual lipopeptides in vitro. From these mixtures, orchard trials have shown a significant reduction in scab incidence of up to 70%. Sensitivity differences were investigated using molecular biology, microscopy and lipidomic techniques. Sensitivity differences to triazole are related to distinct molecular mechanisms, including overexpression of the Cyp51A gene and increased efflux by membrane pumps in the Rs552 strain. Whereas these mechanisms do not seem to be involved in reduced sensitivity to fengycin. Microscopic observations indicate cellular alterations induced by fengycin, suggesting an interaction with plasma membranes. Lipid analyses reveal some variations in sterol and total fatty acid composition as well as phospholipids between strains, which could influence their sensitivity to fengycin. In conclusion, the potential effectiveness of lipopeptides produced by Bacillus as an alternative to chemical fungicides in the biocontrol of apple scab has been highlighted. Electronic Thesis or Dissertation Text fr en PDF 5452324 https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/EDSMRE/2024/2024ULILR031.pdf https://theses.hal.science/tel-04807530 https://theses.hal.science/tel-04807530 https://theses.fr/2024ULILR031/abes https://theses.hal.science/tel-04807530 https://theses.hal.science/tel-04807530 https://theses.hal.science/tel-04807530 Leconte Aline Leconte 1996-05-08 FR 281735603 https://theses.fr/2024ULILR031 2024ULILR031 https://doi.org/10.70675/1aea63abz1878z496bzb148zc555f760d2a1 2024-06-27 Biotechnologies agroalimentaires, sciences de l'aliment, physiologie Université de Lille (2022-....) 259265152 Université de Liège (1817-....) MADS_ETABLISSEMENT_DE_COTUTELLE_1 026431416 Doctorat Docteur es non oui Coutte François MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 144255928 Jacques Philippe MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 139643079 Deleu Magali MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_3 224676288 Muchembled Jérôme MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_4 183314174 Jijakli Haïssam MADS_PRESIDENT_DU_JURY 142871745 Calonne Maryline MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 169257371 Lanterbecq Déborah MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 28173545X Le Cam Bruno MADS_RAPPORTEUR_1 161156355 Fontaine Florence MADS_RAPPORTEUR_2 224487892 École doctorale Sciences de la matière, du rayonnement et de l'environnement (Lille ; 1992-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 148937330 UMR Transfrontalière BioEcoAgro MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 1057473 261582488 ddc:660 Université de Liège Coutte François Jacques Philippe Deleu Magali Muchembled Jérôme Jijakli Haïssam Calonne Maryline Lanterbecq Déborah Le Cam Bruno Fontaine Florence École doctorale Sciences de la matière, du rayonnement et de l'environnement (Lille ; 1992-....) UMR Transfrontalière BioEcoAgro PDF 5452324