Identification des interactions oncogéniques du Polyomavirus à cellules de Merkel
Merkel Cell Polyomavirus physical and functional oncogenic network in Merkel Cell Carcinoma
Antigènes T
BioID
Oncogenesis
Proximal interactomics
Cancer
Merkelome
Polyomavirus de Merkel
Cancérogenèse
Protéines virales
Protéomique
Interactions protéine-protéine
Identification
ADN -- Altération
Épigénétique
Le carcinome à cellules de Merkel (CCM) est un cancer de la peau agressif et de très mauvais pronostic. Ce cancer est lié à la présence du Polyomavirus à cellules de Merkel dans 80% des cas. Ce Polyomavirus exprime deux oncoprotéines virales : sT et LT tronquée. L'expression des deux antigènes T est suffisante à l'émergence du cancer et responsable de la perturbation de checkpoints de signalisation, de la modification du profil épigénétique et de l'évasion immunitaire. L'interactomique et la protéomique nous ont permis d'identifier de nombreux facteurs épigénétiques en relation avec les antigènes T. Nous avons aussi mis en lumières de des mécanismes candidats touchant la régulation de la stabilité protéique, l'expression génique et la stabilité génétique via la voie de réponse aux dommages de l'ADN. Les hypothèses issues de ces analyses ont été testées de manière ciblée. Un lien entre la peptidyl-prolyl cis/trans isomérase et la neddylation a pu être mis en évidence. Nous avons ainsi identifié un mécanisme candidat de régulation de l'activité des complexes d'ubiquitinylation à travers le recrutement de PIN1 et l'isomérisation par un primo de neddylation. L'étude d'EHMT2, régulateur épigénétique d'intérêt, a révélée l'importance de son rôle dans la réponse aux dommages de l'ADN au sein des CCM virus positifs (VP). Nous avons identifié un rôle protecteur de tLT et d'EHTM2 des dommages de l'ADN au sein des CCM-VP. Un rôle de EHMT2 dans la réparation suivant un stress réplicatif est aussi apparu. Nous avons découvert de nouveaux mécanismes importants dans l'oncogénèse des CCM-VP, rapportant pour la première fois un rôle central de tLT dans la gestion des dommages à l'ADN.
Merkel cell carcinoma (MCC) is an extremely aggressive skin cancer with a high mortality rate. In 80% of cases, this cancer is linked to the presence of the Merkel cell polyomavirus which expresses two viral oncoproteins, small T and a truncated form of large T. The expression of these proteins is sufficient for carcinogenesis, inducing the disruption of cell cycle checkpoints, changes in the epigenetic profile, and immune evasion. The combination of interactomics and proteomics approaches allowed us to identify numerous epigenetic factors related to the T antigens. These studies have also highlighted potential mechanisms involving the regulation of protein stability, gene expression, and genetic stability via an altered DNA damage response pathway. The hypotheses formulated following these analyses were investigated in targeted assays. A link between the peptidyl-prolyl cis/trans isomerase and neddylation was demonstrated. We have thus identified a new potential mechanism for regulating the activity of ubiquitination complexes involving the recruitment of PIN1 to these complexes, thus their isomerization, by neddylation. The study of the EHMT2 functions, an epigenetic regulator of interest, revealed the importance of its role in the DNA damage response in virus positive MCC (VP-MCC). We were able to identify a protective role of tLT and EHMT2 in DNA damages in VP-MCC cells. More specifically, we also report a role of EHMT2 in solving single strand DNA breaks following replication stress. Our works have enabled the discovery of new important mechanisms in VP-MCC oncogenesis, reporting for the first time a central role of tLT in DNA damages management.
Electronic Thesis or Dissertation
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Borna Disease Virus 1 Phosphoprotein Forms a Tetramer and Interacts with Host Factors Involved in DNA Double-Strand Break Repair and mRNA Processing
Nicolas Tarbouriech
Florian Chenavier
Junna Kawasaki
Kamel Bachiri
Jean-Marie Bourhis
Pierre Legrand
Lily L.Freslon
Estelle M.N.Laurent
Elsa Suberbielle
Rob W.H.Ruigrok
Keizo Tomonaga
Daniel Gonzalez-Dunia
Masayuki Horie
Etienne Coyaud
Thibaut Crépin
MDPI
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2022
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Human Papillomavirus 42 Drives Digital Papillary Adenocarcinoma and Elicits a Germ Cell–like Program Conserved in HPV-Positive Cancers
Lukas Leiendecker
Tobias Neumann
Pauline S. Jung
Shona M. Cronin
Thomas L. Steinacker
Alexander Schleiffer
Michael Schutzbier
Karl Mechtler
Thibault Kervarrec
Estelle Laurent
Kamel Bachiri
Etienne Coyaud
Rajmohan Murali
Klaus J. Busam
Babak Itzinger-Monshi
Reinhard Kirnbauer
Lorenzo Cerroni
Eduardo Calonje
Arno Rütten
Frank Stubenrauch
Klaus G. Griewank
Thomas Wiesner
Anna C. Obenauf
AACR Journals
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2023
Text
Distinct Regulation of EZH2 and its Repressive H3K27me3 Mark in Polyomavirus-Positive and -Negative Merkel Cell Carcinoma
Marie-Alice Durand
Aurélie Drouin
Alice Mouchard
Laurine Durand
Clara Esnault
Patricia Berthon
Anne Tallet
Yannick Le Corre
Ewa Hainaut-Wierzbicka
Astrid Blom
Philippe Saiag
Nathalie Beneton
Guido Bens
Charlee Nardin
François Aubin
Monica Dinulescu
Christine Collin
Gaëlle Fromont-Hankard
Bernard Cribier
Sara Laurent-Roussel
Kristof Cokelaere
Roland Houben
David Schrama
Paul Peixoto
Eric Hervouet
Kamel Bachiri
Diala Kantar
Etienne Coyaud
Serge Guyétant
Mahtab Samimi
Antoine Touzé
Thibault Kervarrec
Elsevier
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2023
Text
Bachiri
Kamel
Bachiri
1996-12-11
FR
276803531
https://theses.fr/2023ULILS113
2023ULILS113
https://doi.org/10.70675/37900e18z11e8z49e6z995fz41b0e804df49
2023-12-18
Sciences de la vie et de la santé
Université de Lille (2022-....)
259265152
Doctorat
Docteur es
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oui
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Michel
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069436940
Solassol
Jérôme
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Bonnefond
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Coyaud
Etienne
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Touzé
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Monsellier
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Le Romancer
Muriel
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École graduée Biologie-Santé (Lille ; 2000-....)
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Protéomique, Réponse Inflammatoire, Spectrométrie de Masse (PRISM)
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443423
161573533
ddc:570
Salzet
Michel
Solassol
Jérôme
Bonnefond
Amélie
Coyaud
Etienne
Touzé
Antoine
Monsellier
Elodie
Le Romancer
Muriel
École doctorale Biologie-Santé (Lille)
Protéomique, Réponse Inflammatoire, Spectrométrie de Masse (PRISM)
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