• Langue : Français, Anglais
• Discipline : Biologie de l'environnement, des organismes, des populations, écologie
• Identifiant : 2023ULILR076
• Type de thèse : Doctorat
• Date de soutenance : 19/12/2023

Résumé en langue originale

À l'interface entre terre et mer, les estuaires revêtent une importance majeure pour la biodiversité marine. Au cœur de ces écosystèmes estuariens, le microphytobenthos intertidal occupe une place clé au sein du réseau trophique de ces environnements. Ce biofilm intertidal, composé principalement de microalgues, contribue de manière significative à l'activité biogéochimique caractéristique des milieux estuariens en termes de fonctionnement et de bilan de production.C'est autour de la production primaire du microphytobenthos et des mécanismes associés que s'articulent plusieurs études qui composent cette thèse de doctorat. Pour caractériser l'influence des forçages sur la production primaire microphytobenthique, le développement méthodologique d'une enceinte de mesures en laboratoire a été réalisé afin de standardiser, en conditions contrôlées, l'acquisition des mesures de la photophysiologie et du comportement migratoire des microalgues qui composent le biofilm. En utilisant cette méthodologie, nous avons examiné expérimentalement la production primaire ainsi que les réponses migratoires du microphytobenthos de l'estuaire de la Canche, en nous concentrant sur la variabilité des mécanismes à l'échelle journalière. Cette approche a révélé la capacité du microphytobenthos à maintenir pendant plusieurs jours un niveau de production et un rythme de migration synchronisé avec les cycles marégraphiques et nycthéméraux observés sur le site d'étude.La variabilité spatio-temporelle de la réponse du microphytobenthos de l'estuaire de la Canche a également été appréhendée suivant un transect amont-aval en considérant deux hauteurs bathymétriques distinctes et deux périodes de l'année dont les caractéristiques physico-chimiques sont contrastées. Cette dernière étude a mis en évidence l'influence multifactorielle des conditions physico-chimiques de l'environnement estuarien sur la photophysiologie et l'activité migratoire du microphytobenthos. Un effet temporel a été identifié avec une augmentation de la production primaire entre avant et après le bloom printanier, et ce, sur l'ensemble des stations étudiées. De plus, cette étude a montré que l'intrusion d'eau de mer provoque une spatialisation suivant un gradient amont-aval de la production primaire, qui s'est avérée être plus forte à l'embouchure de l'estuaire et plus faible dans la zone de désalure pour les vasières. Sur les plus hauts niveaux bathymétriques, correspondant à la zone de pré-salés, un patron de distribution inverse a pu être observé. Cette différence s'explique par l'effet tampon de la canopée de la végétation, qui entraine une plus grande stabilité des paramétres physico-chimiques et permet une production primaire et une activité migratoire identiques avant et après le bloom printanier.

Résumé traduit

At the interface between land and sea, estuaries hold major importance for marine biodiversity. At the core of these estuarine ecosystems, intertidal microphytobenthos plays a key role within the trophic network of these environments. This intertidal biofilm, primarily composed of microalgae, significantly contributes to the biogeochemical activity of estuarine habitats in terms of functioning and budget.Several studies comprising this doctoral thesis focus on the primary production of microphytobenthos and its associated mechanisms. In order to characterize the environmental influences on microphytobenthic primary production, a methodological development was undertaken in the laboratory to standardize the acquisition of measurements related to the photophysiology and migratory behavior of the microalgae composing the biofilm. Using this methodology, we experimentally studied the primary production and migratory responses of the microphytobenthos in the Canche estuary, with a focus on the variability at a daily scale. This approach unveiled the microphytobenthos' capacity to maintain a rhythm of primary production and migration over several days, synchronized with the observed tidal and diurnal cycles at the study site.The spatiotemporal variability of the microphytobenthos' response in the Canche estuary was investigated along an upstream-downstream transect, considering two distinct bathymetric heights and two periods of the year characterized by contrasting physicochemical conditions. The latest study has highlighted the multifactorial influence of physicochemical conditions in the estuarine environment on the microphytobenthic photophysiology and migratory behavior. A temporal effect was identified, with an increase in primary production between before and after the spring bloom, at all the studied stations. In addition, this study showed that seawater intrusion causes a spatialization of primary production along an upstream-downstream gradient, which was found to be stronger at the estuary mouth and weaker in the mudflat desalination zone. At higher bathymetric levels, corresponding to the salt marsh zone, an inverse distribution pattern was observed. This difference can be explained by the buffering effect of the vegetation canopy, which results in greater stability of physico-chemical parameters and enables identical primary production and migratory activity before and after the spring bloom.