Note ABES Atomic force microscopy usage in a context of multi-mode and multi-sample correlative measures on live cells Utilisation de la microscopie à force atomique dans un contexte de mesures corrélatives multimodales et multi-échantillons sur cellules vivantes PeakForce Tapping Cellules vivantes 570.282 Microscopie à force atomique Automatisation Échantillons biologiques Microbiologie Assez rapidement après son apparition à la fin des années 1980, la Microscopie à Force Atomique (AFM) a démontré des perspectives prometteuses d’applications biomédicales. À l’heure actuelle, elle permet l’étude d’échantillons biologiques allant de la molécule unique à la cellule vivante proche des conditions physiologiques. Bien qu’étant applicable aux cellules eucaryotes et procaryotes, elle est entravée par son faible débit. Alors qu’elle peut être fortement automatisée sur certains échantillons bien caractérisés en air, l’automatisation de l’AFM en liquide reste rare, en particulier en multi-échantillon. Lors de ce projet doctoral, une approche automatisée a été développée pour l’étude des cellules en milieu liquide. Après une introduction du système et des développements nécessaires, nous démontrons l’approche sur des bactéries fixées et vivantes, ainsi que sur des cellules épithéliales. L’utilisation d’automatisation multi-échantillon permet d’augmenter le nombre d’échantillons rassemblés tout en limitant les interactions avec l’utilisateur. Enfin, les développements ultérieurs sont discutés pour aller vers un système automatisé à plus grande échelle sur échantillons vivants. Soon after its development in the late 1980s, atomic force microscopy (AFM) has shown promising applications in the biomedical field. It now allows investigating biological samples from single molecules to living cells under conditions close to physiological. Despite its applicability to both eukaryotic and prokaryotic cells, it is hampered by its low throughput. While heavily automated on some well-characterized samples in air, AFM automation in fluid is very scarce, especially at the multi-sample level. During this doctoral project, an automated approach was developed in fluid, on cells. After introducing the system and the developments required, we demonstrate the approach on fixed and living bacteria as well as on epithelial cells. The usage of multi-sample automation allows gathering a greater number of samples with limited user interaction. Finally, further developments are discussed to lead the path toward higher-scale AFM automation of live samples. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 33857022 application/pdf https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/EDSPI/2018/50376-2018-Dujardin.pdf https://theses.fr/2018LILUI078/abes Dujardin Antoine Dujardin 1992-12-11 BE 235369438 https://theses.fr/2018LILUI078 2018LILUI078 https://doi.org/10.70675/c9ebb3f5zd950z43e6zaff2z2412c10851a2 2018-12-18 Micro-nanosystèmes et capteurs Université de Lille (2018-2021) 223446556 Doctorat Docteur es non oui Duprès Vincent MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 083750533 École doctorale Sciences pour l'ingénieur (Lille ; 1992-2021) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 147297028 Centre d'Infection et d’Immunité de Lille MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 161594832 Bruker Spectrospin MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_2 032234538 ddc:570 Duprès Vincent École doctorale Sciences pour l'Ingénieur (Lille) Centre d'infection et d’immunité de Lille Bruker Spectrospin PDF 33857022