Note ABES Analyse génétique de l'embryogenèse somatique chez la chicorée (Cichorium intybus L.) : cartographie des QTL et gènes candidats Genetic analysis of somatic embryogenesis in chicory (Cichorium intybus L.) : qTL mapping and candidate genes Gènes candidats Embryogenèse somatique Chicorées Reproduction (biologie) Cellules végétales -- Différenciation (biologie) Reproduction asexuée chez les plantes Variabilité génétique Chromosomes végétaux -- Cartes Locus à caractère quantitatif Cellules souches L'embryogenèse somatique (ES) est une voie asexuée aboutissant à la formation d'embryons à partir de cellules somatiques qui ressemble à l'embryogenèse zygotique. Chez la chicorée, une variabilité génétique pour ia capacité à former des embryons somatiques in vitro a été mise en évidence et un génotype K59. embryogène et K28. peu embryogène ont été sélectionnés pour obtenir une descendance F1' Cette variabilité a été exploitée afin d'identifier les régions chromosomiques ou QTL et les gènes Impliqués dans l'ES. Après 7 jours d'induction des explants racinaires en condition d'embryogenèse et 30 jours de développement, les plantules issues (PL) du développement des embryons somatiques et les structures chlorophylliennes unipolaires (SH) ont été comptabilisées. Les caractères PL et SH présentent une distribution normale et continue et une héritabilité supérieure à 63%. Une carte génétique issue du croisement K28*K59 a été construite pour la recherche de QTL liée à J'ES. Six QTL ont été identifiés. expliquant plus de 23% et 44% de variation phénotypique totale pour les caractères PL et SH respectivement. Parmi les 63 gènes candidats cartographiés, 16 co-localisent avec les QTL pour PL et SH. La co-localisation de gènes homologues à SHOOT MERISTEMLESS (STM) et ARGONAUTE (AGO) d'Arabidopsis avec les QTL6 et QTL2, respectivement. est particulièrement intéressante. En effet. ces gènes sont connus pour leur implication dans la maintenance de l'état dédifférencié des cellules souches dans le méristème caulinaire. Avec la détection des QTL pour l'ES. les résultats de cette étude ont fourni pour la première fois des éléments sur le contrôle génétique de l'ES chez la chicorée. Somatic embryogenesis (SE) Is an asexual re-production pathway in which somatic cells form embryos in a process that resembles zygotic embryogenesis. ln chicory a genetic variability in the capacity of somatic embryo formation was found, and two contrasting genotypes were selected K59, embryogenic. and K28, hardly embryogenic were selected for obtain a F1' progeny. Vanabllity for somatic embryo formation was exploited to identify chromosomal regions (QTL) and candidate genes implicated in ES. After 7 days of culture of root explants under SE-inducing conditions and 30 days of development the number of plantlets (PL) and shoot-like structures (SH) obtained were counted. The traits PL and SH showed continuous and normal distributions after log10 transformation, and heritabilities superior to 63%. A genetic map for the K28*K59 progenies was built for a QTL analysis related to ES. Six QTL were detected for both PL and SH that together explained more than 23% and 44% of the phenotypic variation for these traits. respectively. Amongst the 63 mapped candidate genes, 16 co-Iocalised with QTL for PL and SH. ln view of their implication in the maintenance of the undifferentiated state of the stem ceIls in shoot apical meristems. the co-localisation of genes homologous to SHOOT MERISTEMLESS (STM) and ARGONAUTE (AGO) in Arabidopsis wlth QTL6 and QTL2. respectively. is a particular interesting result. With the detection of QTL for SE. the results of this study have for the first time revealed elements in the genetic control of SE in chicory. Electronic Thesis or Dissertation Text fr en PDF 3351868 https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Autres/2009/50376-2009-Clabaut.pdf https://theses.fr/2009LIL10039/abes A consensus genetic map for chicory (Cichorium intybus L.) Cadalen, T. Morchen, M. Blassiau, C. Clabaut, A. Molecular breeding Text Clabaut Aline Clabaut 1981-02-15 FR 140528261 https://theses.fr/2009LIL10039 2009LIL10039 https://doi.org/10.70675/374436f0z02f5z473dz8a27zf5eec7a82754 2009-06-24 Ingénierie des fonctions biologiques Lille 1 026404184 Doctorat Docteur es oui oui Hendriks Theo MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 140528725 ddc:570 Hendriks Theo ASCII PDF 3351868